基因序列都有自己的序列号吗？基因编辑小鼠的名字一长串

相信大部分同学都有这样的经历，阅读文献时常常会看到一些花里胡哨的小鼠名字，由于不清楚它名字的含义，下一秒就忘了。小编刚看文献的时候，看着这么长的名字分分钟就想弃文。

其实，这一长串名字，相当于小鼠的身份证，通过它我们可以知道该小鼠应用了什么技术，哪个基因进行了什么修饰，来源于哪个实验室，背景品系是啥。这期就让我们一起解读基因编辑小鼠的名字含义吧！

常见的基因编辑小鼠主要分为随机转基因小鼠和基因定点修饰小鼠。简单来说，它的名字构成基本是酱紫的：背景品系，连字符“-”加上转基因或定点修饰的基因符号。

1. 转基因小鼠的命名

转基因小鼠名字的基因符号一般由以下四个部分组成：

• 修饰方式：TgX，Tg表示转基因（transgene），X表示DNA插入的方式，如：H代表同源重组，R代表经逆转录病毒载体感染的插入，N代表非同源插入。
• 转入的基因：转入的基因放在圆括号中，不用斜体，因为它们是外来DNA材料的随机插入，并且不是天然基因组的一部分。
• 实验室指定序号：实验室对已成功的转基因品系给予的特定编号。
• 实验室注册代码：标识生产或维持特定动物品系的研究所，实验室或研究者。

基因符号表示例子：

我们可以获得的信息是：

来源：Nathaniel Heintz（研究者）

构建技术：转基因

转入的基因：小鼠的Zfp38基因

我们可以获得的信息是：

来源：Dr. Joel Taurog（研究者）

构建技术：转基因

转入的基因：2个人源基因HLA-B*2705和B2M，*表示包含的基因是突变体

转入报告基因或者重组酶系统（例如，GFP，lacZ，cre）时，它们的只有表达的组织特异性不同，应该在转入基因前表示启动子比如Tg(Zp3-cre)3Mrt

我们可以获得的信息是：

来源：Gail R. Martin（研究者）

构建技术：转基因

转入基因：在Zp3启动子下表达的Cre重组酶系统

完整的转基因小鼠名字格式

我们可以获得的信息为：

背景品系：C57BL/6J小鼠

构建技术：转基因（非同源插入）

转入基因：人的CD8基因组(Ge)

来源：Jon W. Gordon (Jwg)实验室

实验室指定序号：23。

1. 基因定点修饰小鼠的命名

基因定点修饰小鼠名字的基因符号一般由以下几个部分组成：

• 被定点修饰的基因：用基因符号表示，需要斜体。
• 基因修饰方式：利用ES打靶技术构建的小鼠，用tm表示，tm代表targeted mutation；而核酸内切酶系统（比如现在大热的CRISPR/Cas9）介导的基因修饰，用em表示，em代表endonuclease-mediated mutation。修饰方式上标。
• 插入基因：基因敲入小鼠需要标出转入基因，放圆括号中，上标。基因敲除小鼠则没有这个部分。
• 原创实验室序列号，位于修饰方式后。
• 实验室注册代号：同上述转基因小鼠的命名规则有所区别，需要上标。

基因符号表示例子：

• 基因敲入

上图我们可以获得的信息为：

被修饰的基因：En1

修饰技术：ES打靶

插入基因：otx2

来源：W.Wurst实验室(Wrst)

表示En1基因编码区被Otx2基因取代。

• 基因敲除

上图我们可以获得的信息为：

被修饰的基因：小鼠的Fgf1基因

修饰技术：核酸内切酶系统介导的基因修饰

来源：Miche`le Sawadogo（研究者）

表示小鼠的Fgf1基因被敲除。

• 条件性基因敲除

亲本与基因敲除小鼠命名一样，条件性基因敲除小鼠（flox小鼠）与Cre工具鼠交配产生的后代与亲本的区别为，而在亲本名字的序列号后加一个小数点和数字。比如：Tfamtm1Lrsn表示LoxP位点插入Tfam基因的亲本cKO小鼠，Tfamtm1.1Lrsn表示Tfamtm1Lrsn 与Cre工具鼠交配产生的后代。

备注：图片中标注的亲本和子代是为了表示tm1与tm1.1的区别，tm后的数字表示原创实验室序列号。

完整的基因定点修饰小鼠名字格式：

上图的名字我们可以获得的信息为：

背景品系：B6;129；

定点修饰的基因：小鼠的Hbb基因

修饰技术：ES打靶技术

原创实验室序列号：3

插入基因：人的HBG1和HBB基因

来源：Dr. Timothy Townes（研究者）

关于基因编辑小鼠命名，就写这么多了，希望这篇文章对你理解常见的基因编辑小鼠的名字有所帮助，详细的命名规则可以去MGI了解哦。

参考资料：

1. 王超主编,基因修饰小鼠制备常用技术,中国农业大学出版社,2013.12.
2. http://www.informatics.jax.org/mgihome/nomen/strains.shtml#mice
3. http://www.informatics.jax.org/mgihome/nomen/gene.shtml#endim